菌液PCR有条带,但是提不出来质粒是什么原因
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/13 19:24:15
建议:循环次数减少3,Mg离子浓度降低到1.2mm,提高annealing的温度
那就是PCR的问题了,建议用新的试剂再试下,最好先把反应液,酶,引物按比例先配好,再取混合液加引物
土壤环境太复杂,直接从土壤中分离的DNA,有些时候会含有影响PCR效率的抑制剂(各种稀奇古怪的离子,蛋白什么的),最好用专门的土壤DNA提取Kit,还不行的话,得再做进一步的纯化了(过柱去离子,酚氯仿
如果PCR系统没有问题,很可能是质粒和染色体发生了重组.建议提细菌的genomeDNA做一次PCR.如果是阳性,就说明是这样.另外,还可以另挑几个菌落,重新提质粒扩增.
我觉得用elutionbuffer没太大的影响,如果你非要觉得不好的话,只能在转化一遍重新提质粒或者抽成干粉再加水.我们一般用水就行.实在不行去测序呀.提的质粒和空质粒可以比较,如果你插入的基因足够大
高手们好.最近做酶切连接转化,最后做鉴定时,以菌落为模板进行PCR时可以见到有目的条带;当把菌落接种到LB液扩菌后,以菌液为模板进行PCR时却什么东东都没有?请问会是什么原因啊?多多指教啊!建议重新以
就只是你的目的基因菌液PCR扩增不出来么?不过我觉得你如果质粒、电泳、菌落PCR都能验证的话,菌液PCR结果如何都意义不大了.
能确定菌液pcr出来的就是目的条带吗?如果确定,那就是可能质粒抽提和酶切这两步出了问题
原来扩增的时候就有两条带,回收的时候(是凝胶回收吗?)可能因为产物浓度过大,导致两条带没跑开,让你一起切下来了(回收后电泳检测了没?),所以连接后有两种克隆.至于说为什么会出现两种克隆,要具体问题具体
DNA质量过关,扩不出来,可能是你引物设计的问题,建议,多设计几对引物试试,还有就是调整PCR的条件——温度,时间,或者在PCR体系里额外加点离子
一般Marker中亮的条带是100ng,其他的条带是50ng.可以看到你回收之后的条带亮度估计在10ng~30ng左右,如果你的上样体积为10ul,则浓度应该是1ng~3ng/ul,这个浓度是很低的,
问题很多啊.或者是你的PCR仪需要进行荧光校准(如果其他探针也没有信号的话),已经不能收集荧光信号了.或者是你的探针本身就有问题,合成的不好,信号很弱甚至没有信号.或者是你的探针存放时间太长,存放条件
1、内参没有被扩增出来2、电泳时内参没加loadingbuffer或染料
阴性对照的作用就是来判断实验是否有污染的,如果PCR条带和阴性对照都弥散的话,原因应该是污染.污染一般有试剂的污染,也有可能是环境的污染.先说试剂的污染.你设置的阴性对照所用的每一种试剂都存在被污染的
可能还是转膜的条件问题吧,我和你的抗体一样,蛮好用的,你试试摸索转膜时间吧,可以一个样品多点几个孔,隔段时间就剪一条,摸摸时间
恐怕还是cDNA的问题,actin因为量比较丰富,所以即使破坏一些仍能P出来,但你的目的基因就不同了
有很多影响因素:模板浓度,引物浓度,酶在反应过程中的不断消耗,循环数和温度等等.如果你已经P出来目的片段的话温度应该是适合的,可以加大模板和引物的量,建议回收片段后作为模板再P,这样得到的片段会较亮.
这要具体分析.一种可能是你的PCR产物是非特异性片段,所以长度不一,这可以通过和你预期PCR产物的长度进行比较来判断.另一种可能是该基因在不同情况下有不同的剪接模式(alternativesplici
PCR扩增的结果和模板的质量有直接的关系,在PCR扩增中如果模板纯度高,很低的量都可以进行扩增的.提取细菌的DNA量不多但纯度高,即使DNA电泳检测不到条带,PCR仍然能扩出条带.希望你看明白了.
1退火温度不合适2引物不合适3模板有问题4酶由问题