NCBI blastn基因序列结果
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/08/20 02:39:12
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再有:如何找到一个基因的保守性序列.谢谢各位!把不同种生物的这种基因做一个Align,一般会发现以一个区域的同源性很高,这个区域就叫做保守序列.
http://baike.baidu.com/view/2183856.html
看你是要对比几条序列了,双序列比对需要BLAST,NCBI上有,也可以在百度搜索本地版的下载下来,多序列比对需要cluxtalX软件,要把所有基因序列fasta格式放在一起,需要输入所有序列的fast
去NCBI网站,点ORFfinder,把你想查的DNA序列输进去,它会帮你分析这段序列中可能含有的读码框并给出相应的蛋白序列.
根据起始密码子ATG第一个ATG的确定则依据Kozak规则.
把这个基因序列到水稻基因组的数据库去BLAST一下就可以了
有些是有些不是,上面有注明的,你仔细看就知道了.有的写出了内含子和外显子.
用“p53Gallusgallus”和“p53Homosapiens”在NCBI的database中的“gene”选项中搜索即可.这个是人的:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore?term=Lefty2这个网址找到你要的物种的Lefty2基因点链接,就会显示基因序列及蛋白序列=平均相对分子质量108*氨基酸
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/194473617?report=genbank
1.测序最好克隆到载体后进行,比直接测PCR产物好2.测序短,说明你的样本里有抑制剂,比如EDTA等.样本要用水稀释,不能含有抑制剂3.同源性只有34%,说明不是同一种属的.4.如果有好几个,那你可以
基因序列是以基因为基本单位的,而碱基对序列的排布构成了一个个的基因可以说基因序列比碱基序列要大
大多数真核生物的基因都有内含子.需注意的是,在古细菌中也有内含子.在转录后的加工中,从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列.术语内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域.大多数真核结构基因中的间
整合子是一种遗传因素,包含一个能捕获外源基因的位点特异重组系统,这些被捕获的外源基因通常是耐药基因(如编码氨基糖苷类、β-内酰胺类、氯霉素、磺胺类等的基因).这些耐药基因被包含在叫做基因盒的单一的移动
GENSCAN-是一款不错的在线工具,适合在DNA上查找基因序列,预测基因等.序列分析的话,问题很泛泛,不过你要是用BLAST可以去看看NCBI上的在线BLAST,进行序列比对来发现有用的信息http
你要的是人的还是鼠的阿大鼠编码框184atggaggattcacagtcggatatgagcatcgagctccctctgagtcaggagacattttcatgcttatggaaacttcttcct
蛋白质是由氨基酸连接并经过加工在空间中形成不同空间结构才产生具有生物功能的蛋白质.也就是说机体在产生蛋白质前是先通过机体在一定时间,一定部位选择性的表达特定基因(mRNA),真核生物编码一种氨基酸都对
每一种氨基酸都有对应的密码子根据碱基互补配对原则写出信使RNA的核苷酸排列顺序再根据碱基互补配对原则写出DNA的其中一条模板链再用碱基互补配对原则就可以写出DNA的另一条链了
解题思路:分析题图:图示为某二倍体植物细胞内的2号染色体上有M基因和R基因编码各自蛋白质的前3个氨基酸的DNA序列,起始密码子为AUG,则基因M以b链为模板合成mRNA,而基因R以a链为模板合成mRN
你进入Protein的Entrez,用蛋白质AccessionNumber查找到蛋白质之后会给你连接的,每个蛋白质不一样如果没有NC号,就用BLAST搜索,使用tblastn工具,最前面的一个就是相应