文献上看到一种蛋白,有基因序列号,可是上genbank blast一下,只有它自己,怎么设计引物?
来源:学生作业帮 编辑:搜搜考试网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/07/11 02:55:21
文献上看到一种蛋白,有基因序列号,可是上genbank blast一下,只有它自己,怎么设计引物?
有基因序列号,你就可以直接上genebank下载其序列,下载到全序列,你需要扩增的CDS区,也就是编码区,可以全外显子扩增,这样简单一点,也可以做cDNA克隆,然后再做,前者的话就可以直接根据其基因序列NG号设计引物,如果是做CDNA的话就根据其mRNA的序列NM号设计引物.
再问: 我直接根据genebank上的cDNA设计了引物,因为没有找到同源性比较接近的。所以直接就是拿那个基因的序列设计的,引物长度是24bp。可是没P出来。请问我这种情况,还有别的方法可以设计引物吗?谢谢了。
再答: 你是根据其cDNA设计的引物,你需要下提取mRNA,然后反转录成cDNA,才能够扩增出来。如果是根据其基因序列设计的,你需要先将你的目的序列定位到GENE上,然后设计引物
再问: 我直接根据genebank上的cDNA设计了引物,因为没有找到同源性比较接近的。所以直接就是拿那个基因的序列设计的,引物长度是24bp。可是没P出来。请问我这种情况,还有别的方法可以设计引物吗?谢谢了。
再答: 你是根据其cDNA设计的引物,你需要下提取mRNA,然后反转录成cDNA,才能够扩增出来。如果是根据其基因序列设计的,你需要先将你的目的序列定位到GENE上,然后设计引物
文献上看到一种蛋白,有基因序列号,可是上genbank blast一下,只有它自己,怎么设计引物?
逆转录PCR引物,在PUBMED上搜文献上找了一个引物,BLAST了一下,结果如下,但是自己不大会分析,求指导~
怎样用primer-blast设计引物
如何提交基因序列到NCBI GENBANK上?
怎样在Genbank 上查一个基因的全序列
在GENBANK上面查到的线粒体DNA序列,接下来怎么设计PCR引物?
如何在Blast上基因定位
根据GenBank中p53基因的部分序列),设计引物,确定RT-PCR的参数,检测 p53基因在血细胞中的表达情况.
怎么在NCBI上查基因的序列号等相关信息?
NCBI上怎么用BLAST对比序列
请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗?
我想扩增一段目的基因,只知道一个CDS,ATG开始TAA结束的,后续要表达蛋白,怎么设计引物啊?