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对未知物种的引物设计,genbank对该基因暂无数据,怎么办?求软件

来源:学生作业帮 编辑:搜搜考试网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/08/01 15:33:31
对未知物种的引物设计,genbank对该基因暂无数据,怎么办?求软件
我有一对引物对一个科的种类能较好的扩增,我现在想研究另一个科的.我发现无论是文献还是genbank都暂无这方面资料.我想通过临近的另几个科的数据来设计引物.因为是要根据好几条已知序列来做,所以求教有什么软件较好?primer5一直载入aln错误,其他很多软件都是根据1条基因来设计引物的,不支持多条基因.
对未知物种的引物设计,genbank对该基因暂无数据,怎么办?求软件
多序列比对,找到保守序列,把保守序列导入到prime5中设计引物.尽量保证让所有的primer序列落到保守区或者primer3'端落到保守区