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基因中map和read是什么意思

来源：学生作业帮 编辑：搜搜考试网作业帮 分类：综合作业 时间：2024/07/05 07:52:41
基因中map和read是什么意思
RPKM是将map到基因的read数除以map到genome的所有read数(以million为单位)与RNA的长度(以KB为单位)。这个概念怎也理解不了
基因中map和read是什么意思
此处,map的意思是“比对到基因图上”；read是指测序出的一条序列,也称“读序”.
正在做RNA seq?
RPKM,Reads Per Kb per Million reads
RPKM=（10的9次方×C）/（N×L）.RPKM为某基因的表达量,C为唯一比对到该基因的reads数,N为唯一比对到参考基因的总reads数,L为该基因编码区的碱基数.RPKM法能消除基因长度和测序量差异对计算基因表达的影响,计算得到的基因表达量可直接用于比较不同样品间的基因表达差异.
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